Python C-ext 命名空间与常规 python 子模块混合

这个问题有一些相似之处:

Nested Python C Extensions/Modules?

只有轻微的扭曲。在这里，我不是要混合使用两个 C-ext，而是混合使用一个 C-ext 和一个常规 python 子模块。

有没有办法让 C 扩展在符号“module.so”和子模块中的符号之间共享模块命名空间？

我的模块结构是这样的:

facs/ 
    facs/ 
      __init__.py 
      setup.py 
      facs.so 
      [*.c files] 
      utils/ 
        __init__.py 
        galaxy.py 

如果我从层次结构中删除“utils”，我可以导入 facs 并查看 facs.so 方法:

>>> import facs 
>>> dir(facs) 
['__doc__', '__file__', '__name__', '__package__', 'build', 'query', 'remove'] 

但是当我把 utils 子模块放回去并尝试导入不同的部分时，一个 namespace 似乎掩盖了另一个(utils 掩盖了 facs.so 导出的符号):

>>> import facs 
>>> dir(facs) 
['__builtins__', '__doc__', '__file__', '__name__', '__package__', '__path__'] 
>>> import facs.utils 
>>> facs.utils.galaxy.rsync_genomes("phix") 
Traceback (most recent call last): 
  File "<stdin>", line 1, in <module> 
AttributeError: 'module' object has no attribute 'galaxy' 
>>> from facs.utils import galaxy 
>>> galaxy.rsync_genomes("phix") 
'Hello world' 

如您所见，在 dir(facs) 之后，build、query 和 remove 都消失了并且 银河 除非我执行 from facs.utils import galaxy 否则无法正确导入 重新使用初始导入语句并直接通过 facs.utils.galaxy.rsync_genomes() 访问。

总而言之，我对这个模块的预期用途是:

>>> import facs 
>>> dir(facs) 
['__doc__', '__file__', '__name__', '__package__', 'build', 'query', 'remove' 
, 'utils'] <--- (Directly accessible from "facs") 
>>> facs.utils.galaxy.rsync_genomes("phix") 
'Hello world' 

(目前正在开发中)代码位于:

https://github.com/brainstorm/facs/tree/develop

以防有人想自己尝试。我正在使用 virtualenvs 和我的 $PYTHONPATH 似乎是正确的:

/home/roman/.venvburrito/lib/python: 
/home/roman/.virtualenvs/py27/lib/python2.7/site-packages 

安装似乎也成功了:

cd ~/.virtualenvs/py27/lib/python2.7/site-packages/facs-2.0dev-py2.7.egg/ 
(py27)$ ls 
EGG-INFO  facs.py  facs.pyc  facs.so  utils/ 

似乎没有 __init__.py 文件实际上被复制到顶级目录，但触摸它与否并不影响上述导入行为。

有什么想法吗？提前致谢!

请您参考如下方法:

请注意，您首先导入的是 so 文件，而不是 facs 包。您是否在 facs 包源目录上运行 python 控制台？

尝试走出包目录，一切都会有意义。

另外，next import 并不是说​​你的 facs 目录后面的所有模块都将被导入:

>> import facs 
>> dir (facs) 
['__builtins__', '__doc__', '__file__', '__name__', '__package__', '__path__'] 

您必须在每个 __init__.py 文件中设置您的导入，例如，如果您想在 import 时从 .so 文件中导出一些符号facs，您的 __init__.py 文件中应该包含以下内容:

>> from _facs import function_name, function_name ..... 

然后，当您import facs 时，它会为您导入这些函数。

对您的子包实用程序采用相同的模式。

我还建议将您的 facs.so 文件重命名为 _facs.so 文件以避免包名称和模块名称之间的名称冲突。